इन दूर की भूमि का उपनिवेशवाद जेसुइट मिशनरियों के एक समूह की अटूट इच्छाशक्ति और अथक परिश्रम के बदौलत हासिल किया गया था, जो यह जानते हुए भी कि विजेता अबोरियों को वश में नहीं कर पाए थे, उन्होंने उनके लिए सुसमाचार लाने का फैसला किया, इस प्रकार इस शब्द के साथ पहुँचे। कि हथियारों के माध्यम से हासिल नहीं किया गया था।
यह इस प्रकार से था कि 17 वीं शताब्दी के अंत में, जेसुइट यूसेबियो किनो की उत्साही पहल के तहत, जिन्होंने एडमिरल इसिड्रो एटांडो वाई एंटिलोन के अभियान को शुरू करने के लिए स्पेनिश अधिकारियों से अनुमति प्राप्त की, मिशनरियों को उस समय एक द्वीप पर माना जाने लगा। अपने अदम्य निवासियों को इकट्ठा करने के लिए। अनुमति देने के लिए, क्राउन ने यह शर्त लगाई थी कि विजय स्पेन के राजा के नाम पर की जाए और मिशनरियों ने स्वयं उपक्रमों को चलाने के लिए संसाधन प्राप्त किए।
पहला मिशन, सांता मारिया डी लोरेटो, 1697 में फादर जोस मारिया सल्वाटिएरा द्वारा स्थापित किया गया था, जो तराहुमारा में था, और जिसे फादर किनो ने महान कार्य करने का प्रस्ताव दिया था। सांता मारिया डी लोरेटो एक सौ से अधिक वर्षों के लिए राजनीतिक, आर्थिक और धार्मिक राजधानी कैलिफोर्निया के लिए था।
एक सदी के अगले तीन-तिमाहियों के दौरान, मिशनरियों ने अठारह शानदार किले की एक श्रृंखला की स्थापना की, जो तथाकथित "शाही सड़क" से जुड़ा हुआ था, जिसे उन्होंने खुद बनाया, लॉस काबोस क्षेत्र को जोड़ने, प्रायद्वीप के दक्षिण में, वर्तमान सीमा के साथ हमारी सीमा तक। उत्तर में पड़ोसी; यह संभव था क्योंकि मिशनरियों के बीच निर्माण और हाइड्रोलिक इंजीनियरिंग के ज्ञान के साथ पादरी थे।
इन दुर्जेय निर्माणों में से कुछ सही स्थिति में जीवित रहते हैं, जैसे कि सैन इग्नासियो, 1728 में फादर जुआन बाउतिस्टा लुयांडो द्वारा निर्मित सबसे सुंदर और सबसे अच्छी तरह से संरक्षित। सैन फ्रांसिस्को जेवियर की स्थापना, 1699 में, जिसमें एक विनम्र एडोब चैपल और एक पुजारी का घर शामिल था, जो फ्राय फ्रांसिस्को मारिया पिककोलो द्वारा बनाया गया था; वर्तमान इमारत 1774 में फादर मिगुएल बारको द्वारा बनाई गई थी, और इसकी सुंदर वास्तुकला के कारण इसे "बाजा कैलिफ़ोर्निया सुर के मिशनों का गहना" माना गया है; लोरेटो के 117 किलोमीटर उत्तर में फादर जुआन मारिया बसालडूआ द्वारा 1705 में स्थापित सांता रोजालिया डी मुलेग की, यह सबसे अच्छी स्थित में से एक था, क्योंकि यह समुद्र द्वारा एक नखलिस्तान में बनाया गया था।
मिशनों ने वास्तुकला की सुंदरता और सजावट की समृद्धि को एक व्यावहारिक वातावरण के साथ जोड़ा, जिसने स्थायी बस्तियों को उनके आसपास स्थापित करने की अनुमति दी। मिशनरियों ने न केवल आदिवासियों को प्रचारित किया, बल्कि रेगिस्तान को खजूर से फलाना सिखाया; उन्होंने मवेशियों और मक्का, गेहूं और गन्ने की खेती शुरू की; वे भूमि को एवोकाडो और अंजीर जैसे फलों के पेड़ बनाने में कामयाब रहे, और शराब और तेल की आवश्यकता वाले धार्मिक संस्कारों का पालन करने के लिए, उन्होंने बेल और जैतून के पेड़ की खेती करने की अनुमति प्राप्त की, जो बाकी हिस्सों में निषिद्ध था। स्पेन, और आज इस क्षेत्र के लिए उत्कृष्ट वाइन और जैतून का तेल का उत्पादन किया जाता है। और अगर यह सब पर्याप्त नहीं था, तो उन्होंने पहले गुलाब की झाड़ियों को भी पेश किया जो इन जमीनों में पनपी थीं और आज पूरे प्रायद्वीप के पार्कों और उद्यानों को सुशोभित करती हैं।
